МСКТ обладает наиболее высокой чувствительностью в визуализации переломов и деструктивных изменений костной ткани. Поэтому это лучший способ диагностического исследования при подозрении на травматическое повреждение мелких и длинных трубчатых костей и суставов.
Также метод МСКТ позволяет визуализировать патологические изменения костного мозга костей, в том числе опухолевого характера. Помимо костных структур, при проведении МСКТ можно выявить патологические изменения в окружающих кость мягких тканях и органах. МСКТ широко используется в травматологии и ортопедии, ревматологии для определения степени выраженности изменений при артрозе и артрите, а также в онкологии, с целью определения деструктивных изменений кости при опухолевом процессе.